Los próximos 3 años; el Gobernador, Francisco Domínguez Servién, tendrá que gobernar y preparar su salida del poder, con un Congreso con Mayoría Panista, pero con una oposición nueva, con la que no ha negociado anteriormente: la de Morena.
Tras la jornada del domingo Querétaro sigue pintado de azul, pero la capital del estado se debate entre el 1ero y 2do lugar que mantienen una pelea cerrada con mil votos de diferencia y apenas el 68 por ciento de las casillas computadas hasta el cierre de esta edición. Sin embargo, Acción Nacional mantiene el control casi total de los municipios y el PRI fue arrastrado a la tercera fuerza política en el Congreso Estatal.
La contienda por la capital del estado fue una batalla en campo abierto. Contrario a lo que se vislumbraba tras las últimas encuestas, arrojó bajas sensibles para Acción Nacional y triunfos Morenistas en algunos distritos: Manuel Velázquez Pegueros, en el Distrito 2; Tania Palacios Kuri, en el 3 y Eric Salas González, en el 1, perdieron sorpresivamente ante los candidatos de Morena en distritos que supondrían una votación amplia para el PAN y que cerraron aún más la votación para la alcaldía capitalina.
Sin embargo, no fue suficiente para diluir del todo la ventaja de Nava Guerrero, quien, de mantenerse la tendencia despachará en Centro Cívico a partir de octubre.
El candidato del PRI, Pancho Pérez, se instaló en la tercera posición, el único en lograr arriba del 3 por ciento para colocarse en el cabildo fue Luis Gabriel Osejo. Será el primer regidor independiente.
El PRI se fue en blanco en la elección federal de Querétaro mientras que en lo local no solo cayó hasta la tercera fuerza política del estado, sino que festejó solo cuatro triunfos municipales y una diputación: Celia Amador en Jalpan de Serra, Ileana Montes en Arroyo Seco, Isidro Garay Pacheco en Pinal de Amoles y Héctor Magaña que se impuso en Tequisquiapan.
Corregidora con Roberto Sosa se mantiene pintado de azul al hacer dupla con Antonio Zapata Guerrero en la diputación local del VII Distrito, muy lejos quedó el PRI-PVEM de Ricardo Astudillo, incluso rebasado por Gaby Moreno de Juntos Haremos Historia. En San Juan del Río, Guillermo Vega del PAN repetirá como alcalde.
En total Acción Nacional se quedó con 12 de los 18 municipios y el PRI con 5; por primera vez en la historia habrá un municipio gobernado por un candidato independiente (San Joaquín) y Morena le arrebató al PRI la alcaldía de San Joaquín.
Los panistas tendrán mayoría en el Congreso Estatal con 10 de los 15 distritos, mientras que Morena fortalecerá su bancada con 3 diputados de mayoría. El PRI por su parte, tendrá una estrepitosa caída al ganar solo en 2 distritos.
En cuanto a representantes federales: La fórmula de Mauricio Kuri y Lupita Murguía tendrá las riendas acompañados por Gilberto Herrera Ruiz de Morena. Los distritos federales tendrán a la panista Sonia Rocha Acosta en el 1 distrito, Morena arrebató los distritos 2 y 3 con Jorge Nieves y Beatriz Silva Robles, mientras que el cuarto y quinto distritos quedaron en manos de los panistas Felifer Macías y Ana Paola López.
Municipios, sorpresas morenistas e independientes
| MUNICIPIO | CANDIDATO | PARTIDO /COALICIÓN |
| Amealco de Bonfil | Rosendo Anaya Aguilar | PAN |
| Arroyo Seco | Ileana Guadalupe Montes Ríos | PRI-PVEM |
| Cadereyta de Montes | León Enrique Bolaño Mendoza | PAN-PRD |
| Colón | Alejandro Ochoa Valencia | PAN |
| Corregidora | Roberto Sosa Pichardo | PAN-PRD-MC |
| El Marqués | Enrique Vega Carriles | PAN* |
| Ezequiel Montes | María Guadalupe Pérez Montes | PAN-PRD-MC |
| Huimilpan | Leticia Servín Montoya | PAN-PRD |
| Jalpan de Serra | Celia Amador Enriques | PRI-PVEM |
| Landa de Matamoros | Marina Ponce Camacho | PAN-PRD-MC |
| Pedro Escobedo | Isidro Amarildo Bárcenas Reséndiz | PAN-PRD-MC |
| Peñamiller | Agnoli García Rosales | PRI |
| Pinal de Amoles | Isidro Garay Pacheco | PRI |
| Querétaro | Luis Bernardo Nava Guerrero | PAN |
| San Joaquín | Belem Ledesma Ledesma | Independiente |
| San Joan del Río | Guillerno Vega Guerrero | PAN-PRD-MC |
| Tequisquiapan | Isaac Castro Sahade | Morena |
| Tolimán | Ma. Guadalupe Alcántara de Santiago | PAN-PRD. MC |
*39% de las actas computadas.
Congreso panistas con oposición de Morena
| DISTRITO | CANDIDATO | PARTIDO / COALICIÓN |
| Distrito I | Paloma Arce Islas | Morena-PES-PT |
| Distrito II | Ricardo Caballero González | Morena-PES-PT |
| Distrito III | Mauricio Alberto Ruiz Olales | Morena-PES-PT |
| Distrito IV | Agustín Dorantes Lambarri | PAN-PRD |
| Distrito V | Gerardo Ángeles Herrera | PAN-PRD |
| Distrito VI | Elsa Adane Méndez Álvarez | PAN-PRD |
| Distrito VII | Antonio Zapata Guerrero | PAN |
| Distrito VIII | Verónica Hernández Flores | PAN |
| Distrito IX | Roberto Carlos Cabrera Valencia | PAN |
| Distrito X | José González Ruiz | PAN |
| Distrito XI | Martha Daniela Salgado Márquez | PAN |
| Distrito XII | María Guadalupe Cárdenas Molina | PRI |
| Distrito XIII | Beatriz Marmolejo Rojas | PAN |
| Distrito XIV | Leticia Rubio Montes | PAN |
| Distrito XV | Karina Careaga Pineda | PRI |
Bancadas:
| Morena-PES-PT | 3 |
| PAN (PRD) | 10 |
| PRI | 2 |