De los 18 municipios de Querétaro, el Partido Acción Nacional (PAN) gobernaría en 11 alcaldías, según datos del Programa de Resultados Preliminares.
Se trata de Tolimán, Cadereyta, Peñamiller, Pinal de Amoles, Colón, Landa de Matamoros, San Juan del Río, Pedro Escobedo y Corregidora, El Marqués y Querétaro.
Mientras que en Ezequiel Montes el PAN obtuvo el triunfo en alianza con el Partido de la Revolución Democrática (PRD).
Mientras que el Partido Revolucionario Institucional (PRI) ganó sólo en Amealco, Morena por su parte ganó Arroyo Seco Seco, mientras que el Verde lo hizo en San Joaquín y Huimilpan, y dos independientes, uno Tequisquiapan y otro en Jalpan.